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Bisher haben wir ausschließlich Nucleotide BLAST (blastn) verwendet und mit einer Nukleotid-Abfragesequenz die Datenbank von Nukleotidsequenzen durchsucht. Auf der BLAST-Einstiegsseite finden Sie eine Übersicht weiterer BLAST-Varianten, bei denen andere Kombinationen von Abfragesequenz und Datenbank verwendet werden.

Blast Programme

blastn vergleicht eine Nukleotidsequenz mit einer Nukleotiddatenbank
blastp vergleicht eine Proteinsequenz mit einer Proteindatenbank (Protein BLAST)
blastx vergleicht eine in allen sechs Leserastern (beide Stränge!) übersetzte Nukleotidsequenz mit der NCBI-Proteindatenbank
tblastn vergleicht eine Proteinsequenz mit einer in allen sechs Leserastern übersetzten Nukleotiddatenbank
tblastx vergleicht eine in allen sechs Leserastern übersetzte Nukleotidsequenz mit einer in allen sechs Leserastern übersetzte Nukleotiddatenbank
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