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Neben der Wahl des geeigneten BLAST-Programms bietet die Benutzeroberfläche eine Reihe von nützlichen Anpassungsmöglichkeiten
- Einstellung der Datenbanken für die Suche
Choose Search Set – Database - Einstellung des Organismengruppen für die Suche
Choose Search Set – Organism - Anpassung der Algorithmus-Parameter der BLAST-Variante
General Parameters
Scoring Parameters
Filters and Masking