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Nach der rein morphologischen Betrachtung der Darmentwicklung stellt sich die Frage, welche Gene an der Entstehung dieser relativ komplexen Strukturen beteiligt sind. Zur Beantwortung dieser Frage werden häufig folgende Ansätze gewählt:
- Mutanten werden gesucht, bei denen die Darmentwicklung betroffen ist.
- Gene werden gesucht, die in den relevanten Geweben zum richtigen Zeitpunkt exprimiert sind.
Wenn solche Gene gefunden sind, schließen sich meist Untersuchungen an, die klären sollen, wie Gene bei der Entwicklung der betrachteten Strukturen miteinander wechselwirken.